Remove jar files that are no longer needed from setcp.sh

Address some edge cases related to bootstrapping a fresh system.
Improve diagnostics when command line is not quite correct.

More unit testing.

Another unit test.

Clean up error handling to make things slightly friendlier on an initial install.

Restructure use of static field m_bundle to improve the odds that multiple instances will function as expected.

Further unit tests:  CFB and Delta

Further unit tests:  Util and Delta.

Further unit tests:  loading a variable.

Further unit tests:  getVarId()

Further unit tests:  getVar()

Adjust unit test for intentional behaviour change of Util.objsAreEqual().

Add further unit tests.

Avoid unit test failures when cfb.properties is not found in the classpath.

Add extra files that should have been included in the previous commit.

Add unit tests.  Make DbStore handle cases where the bug type or category
is not present in the message collection more gracefully.

Implement BugCollection.hashCode()

Work toward improving solidity.  Add a few more unit tests, and some toString()
methods that make debugging variable dumps more useful.

Check edge cases in Location getters

Correct mistaken condition in previous checkin.

Avoid NullPointerException in HtmlReport.writeSummary().

Fix null-pointer dereference in Delta.java.

Store db parameters in Config object, not in CFB object.

Add the concept of "Project Name" to the RUNS table in the database.

This permits multiple projects to share one database, keeping delta comparisons distinct between them.

Run CFB from the jenkins_invoke directory, not from the directory being analyzed.

Improve jenkins_invoke.sh

DM_DEFAULT_ENCODING:  Be explicit that we're using 7-bit ASCII when sending email.

MS_SHOULD_BE_FINAL:  make constant String "final"

Exclude "METHOD_CALLED" references from consideration as a bug's principal location.

Swap MimeType and Content to their correct positions when invoking MimePart

DM_DEFAULT_ENCODING:  Be explicit that our HTML gets written in UTF-8.

DM_DEFAULT_ENCODING:  Be explicit that we want the system default encoding.

SQL_PREPARED_STATEMENT_GENERATED_FROM_NONCONSTANT_STRING:  Invoke nextval() using a prepared statement parameter.

SendMail:  add quotes around boundary type specification.

Address EI_EXPOSE_REP and EI_EXPOSE_REP2 FindBugs warnings.

Making the internal contents of our class mutable by outsiders without our knowledge may be considered harmful.

Update script to invoke an analysis from inside Jenkins

Fix compile error

If a build/test error occurs, treat it as an error

Start support for Sqlite

Remove debug logging.

Add debug logging.

SendMail:  make charset expected on socket reads explicit.

Command:  make reliance on system default encoding for reading streams explicit.

analyze.sh:  script to invoke CFB from Jenkins.

Note that some reworking will be needed to make this generally applicable.

SendMail:  after '.' that terminates "DATA", send only one CRLF, not two.

Don't try to output HTML unless an output file is specified.
(Dereferencing a null pointer is considered harmful).

Switch from javax.mail to net.jaekl.qd.SendMail.

Add unit tests for Config.java.

Add a bare-bones implementation of SMTP.
Needs testing.

Add email notifications.

Add ability to output HTML report of differences found between two versions.

(Finally) reach the point where we have some useful, if basic, functionality.
Delta now computes difference between previous run and the current one,
and supports a text dump of the new, fixed, and old bugs.

Add ability to load previously found bugs back out of the database.

Avoid deprecation warnings in ResultSetMock.

Add some unit testing of the CfbSchema.

Partial implemenation of load-Analysis code.

Modified storage of TIMESTAMPTZ to ye olde workaround:  store milliseconds since the Unix epoch.
It seems that, even in 2015, we still haven't got a reliable mechanism to load TIMESTAMPTZ
via JDBC, unless you roll your own converter from java.sql.Timestamp.toString(), and that is
way too brittle (and more work than I feel like engaging in).

Add computation of deltas (differences between Analysis runs).

Add local variable information to DB store.

Change schema definition mechanism, to simplify references to table columns in SQL code.

Add found bugs to database.

Some progress toward implementing store(Analysis).

A few changes:

(1) improve sequence support so that sequences can have their next value fetched from the DB

(2) add option ("-r") to remove (drop) the schema and all associated data from the db

(3) populate the bugs and categories tables when creating the database

Restructure database code.

Add code to load bug categories and patterns from the FindBugs messages.xml file.

Unit testing:  confirm that Analyzer can parse some sample XML
input, and that the result passes some very basic sanity checks.

A bit more testing

Add jcov jars.

Add missing file that should have been in previous commit.

Improve XML parsing to handle attributes as well.
Add debug-log dump() function to validate that XML has been parsed correctly.
Update (C) statements.

Add knowledge about the specific FB tags

Partial implementation of XML parse for FindBugs output

Minor fine-tuning of findbugs command execution

Add ability to execute FindBugs

Bring things to a state where the basic DB schema gets auto-created if it doesn't yet exist.

Some progress toward implementing connection to DB and auto-schema-creation.
Neither functional nor tested (yet).

Initial commit.